plink [plink][genetics]遺伝子解析ソフトPLINKで行うQuality control
PLINK
以下のコード中では、"--"（ハイフン\(2\)つ）と"-"（ハイフン\(1\)つ）の違いには十分注意。
データのQuality controlのプロトコル
こちらの記事を参考に。
必要...
statistics
plink 
statistics [Statistics][Mendelian randomisation]メンデルランダム法とはなにか。
出典
BMJの記事から。
また、Tylerの解説記事も参照した。
また、実際の手順については以下のprotocol記事を参照した。
さらに、Rのpackageについてはこちら。
...
R [Statistics][Stata][Multi-collinearity]多重共線性マルチコリニアリティとは何か？
多重共線性とは
マルチコ、などと言うときもある。多重共線性Multicollinearityとは、一般重回帰モデルにおいて、説明変数の中で相関関係が高いものが含まれることを言う。結果として、予測エラーがインフレーションを起こし、真の...
statistics [statistics][統計][ランダム化臨床試験]ブロックランダム化とはなにか
なぜランダム化を行うのか
臨床試験とは、ある特定の薬剤や治療の効果を見るために行われる。臨床試験では様々なバイアス(bisa)、偏りが生じる。例えば、ある疾患（がんでもなんでもよい）に対して、内服治療と手術治療のどちらが優れているの...
python [Statistics][Python][統計]与えられたデータの分布について確認する
与えられたデータの分布について
データ解析の基礎となるが、与えられた（あるいは収集した）データがどのような分布を有するかである。ヒストグラムを描いてデータ分布の性状を確認することが重要であるが、例えば分布が正規分布やt分布とどれほど...
stata [Statistics][Stata]そもそもマルチレベル分析とはなにか
マルチレベル分析
具体的なsoftwareのcodeではなく、極めて簡単な部分からマルチレベル解析について学習する。ただし、簡単なStataのcodeは掲載する。
Multilevel分析とは階層性のあるデータの解析に用いられ...
statistics [Statistics]統計モデルにどのような確率分布を採用するか
簡単なまとめとして
こちらを参照。
テーブル
統計分布特徴ポワソン分布データが離散値、\(0\)以上、上限なし、標本平均\(\approx\)標本分散負の二項分布データが離散値、\(0\)以上、上限なし、標本平均...
stata [Stata][Multileve]Stataでのマルチレベル分析について
マルチレベルMultilevel分析
色々な資料はインターネット上に転がっているが、ここではPrinceton大学の講義資料に沿って学習する。
Stataのxtmixedについてのリンクはこちら。
まとめ
...
statistics [Statistics]Bayesian Data Analysis Third edition part2
Link
長くなりすぎたので分割。Part1はこちら。
Part1
Part1 Fundamentals of Bayesian Inference
Chapter 3 Introduction to ...
statistics [Statistics][時系列データ]経済・ファイナンスデータの計量時系列分析
計量時系列分析
いわゆる龍義本。リンクはこちらから。
pdfも無料で落とせるらしい。
1. 時系列分析の基礎概念
1.1 時系列分析の基礎
1.1.1 時系列分析の目的
時系列データ解析...