イントロダクション
PubMedとは何か
PubMedは、米国国立医学図書館(NLM)が運営する無料の生物医学文献データベースで、医学、看護学、歯学、薬学、基礎生物学などの分野の論文情報が収録されている。
主な機能と利用方法
PubMedを利用すると、研究論文のタイトルや抄録、出版情報などを検索・閲覧できる。また、一部の論文では、フルテキストへのリンクが提供されている。
PubMedでの基本的な検索方法
キーワード検索
検索ボックスにキーワードを入力し、検索を実行する。例えば、「アルツハイマー病」というキーワードで検索する場合、検索ボックスに “Alzheimer’s disease” と入力して検索ボタンをクリックする。
複数キーワード検索
複数のキーワードを組み合わせて検索する場合、キーワードをスペースで区切って入力する。例えば、「アルツハイマー病」と「治療」の両方のキーワードを含む論文を検索する場合、検索ボックスに “Alzheimer’s disease treatment” と入力して検索ボタンをクリックすれば良い。
筆者検索
特定の筆者による論文を検索する場合、検索ボックスに筆者の名前を入力し、”author”フィールドを指定する。例えば、筆者 “John Doe” の論文を検索する場合、検索ボックスに “Doe J[author]” と入力して検索ボタンをクリックする。
筆者とキーワードの組み合わせ検索
特定の筆者が執筆した特定のキーワードを含む論文を検索する場合、筆者名とキーワードを組み合わせて入力する。例えば、筆者 “John Doe” が執筆し、「アルツハイマー病」に関する論文を検索する場合、検索ボックスに “Doe J[[author] AND Alzheimer’s disease” と入力して検索ボタンをクリックする。
詳細検索とフィルター方法の活用
詳細検索ビルダーの使い方
詳細検索ビルダーを使うと、さまざまな検索条件を組み合わせて複雑な検索クエリを作成できる。これにより、より具体的な検索条件を設定して、目的に合った文献を効率的に見つけることができる。
タイトル、ジャーナル、出版日などのフィルター方法
さまざまなフィールド(タイトル、ジャーナル、出版日、MeSH用語など)を使って検索条件を絞り込むことができる。これらのフィルター方法は、単独で使用することも、ブール演算子(AND, OR, NOT)を使って組み合わせることもできる。
MeSH用語での検索
MeSH(Medical Subject Headings)は、医学文献を分類するための標準化された用語である。MeSH用語を使って検索すると、より関連性の高い文献を見つけることができる。
記事タイプや言語、資金提供機関などのフィルター方法
記事のタイプ(オリジナル研究、レビュー、症例報告など)、言語、資金提供機関を指定して検索することができる。これにより、必要な情報に絞り込んで検索が行える。以下に具体例を示す。
- [title]: タイトルでキーワードを検索する場合に使用する。例: “Alzheimer’s disease”[title]
- [journal]: 特定のジャーナル名で検索する場合に使用する。例: “Nature”[journal]
- [pubdate]: 出版日で検索する場合に使用する。例: “2021/01/01″[pubdate] : “2021/12/31″[pubdate] (2021年の論文を検索)
- [mesh]: MeSH用語(医学主題語)で検索する場合に使用する。例: “Diabetes Mellitus”[mesh]
- [affiliation]: 著者の所属機関で検索する場合に使用する。例: “Harvard University”[affiliation]
- [articletype]: 記事のタイプ(例: オリジナル研究、レビュー、症例報告など)で検索する場合に使用する。例: “Review”[articletype]
- [language]: 記事の言語で検索する場合に使用する。例: “Japanese”[language]
- [gr]: ある特定の資金提供機関からの研究助成による論文を検索する場合に使用する。例: “National Institutes of Health”[gr]
- [pdat]: 入力された日付範囲に基づいて、オンラインで最初に公開された論文を検索する場合に使用する。例: “2021/01/01″[pdat] : “2021/12/31″[pdat] (2021年にオンラインで公開された論文を検索)
PubMed Centralとオープンアクセス論文の利用
PubMed Centralの概要
PubMed Central(PMC)は、オープンアクセスの生物医学文献データベースで、PubMedに収録された論文のうち、無料でフルテキストを閲覧できるものが収録されている。
オープンアクセス論文の検索方法
PubMed検索結果画面で、”Free full text”フィルターオプションを選択することで、オープンアクセスの論文のみを表示することができる。
My NCBIアカウントの活用
My NCBIアカウントの機能
My NCBIアカウントを作成すると、検索履歴、アラート、お気に入りの管理が可能になる。これにより、検索結果の追跡や検索条件の保存、新着論文の通知を受け取ることができる。
検索履歴、アラート、お気に入りの管理方法
My NCBIアカウントにログインすると、検索履歴を確認できる。また、「保存された検索」機能を使って、定期的に検索を実行し、新しい検索結果がある場合にアラートを受け取ることができる。お気に入りの文献を「コレクション」として保存し、簡単にアクセスできるようにすることも可能。
効率的なPubMed検索のコツ
検索クエリの最適化
キーワードや検索フィールドを適切に選択し、ブール演算子(AND, OR, NOT)を使って組み合わせることで、検索クエリを最適化することができる。
ブール演算子を使った複雑な検索条件の作成
複数のキーワードや検索フィールドをブール演算子で組み合わせることで、より複雑な検索条件を作成できる。これにより、関連性の高い文献を効率的に見つけることができる。
検索結果のソートやフィルタリングの活用
他の文献データベースとの併用
PubMedの限界と対処法
PubMedは、生物医学分野に特化したデータベースであり、他分野の文献や一部の学術誌がカバーされていない。その場合、他の文献データベースを併用することが有効である。
おすすめの他の文献データベース
PubMedと併用して使うことができる文献データベースには、Web of Science, Scopus, Embase, Google Scholarなどがありる。これらのデータベースもそれぞれ特徴があり、異なる検索機能やカバー範囲を持っている。必要に応じて、複数のデータベースを利用することで、さらに幅広い文献情報を得ることができるだろう。
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